「天后宫湄洲祖庙」，创建於宋雍熙4年(987)，即妈祖林默娘逝世当年。另，位於莆田县西天尾乡龙山村林搀打诅祠(林姓祠堂)，人称「九牧祖祠」。内留有妈祖，先辈绸吴提之石刻，反妈祖石雕神像。曾在迎奉湄州妈祖莅台时，随同而来。 

　　湄洲岛对岸贤良港「天后祖祠」建於未朝。其中妈祖软身神像，系南宋精品。亦为台湾妈祖回銮时，谒祖必经之庙。 

　　宋徽宗宣和5年(1102），赐「顺济」庙额。 

　　元代，敕封妈祖为「护国明著天妃」。朝廷派官修建湄洲祖庙。 

　　明洪武7年(1374)，重建寝殿、香事、鼓楼、山门。扩大规模复塑神像。并於正殿左边，「朝天阁」。 

　　永乐初年，韶扩大庙宇。派遣大臣内官致祭。

　　宣德6年(1431)，郑和领兴平二卫指挥、千百户等，及府、县官员买辦修整，并增 御祭一坛。「天后宫湄洲祖庙」，创建於宋雍熙4年(987)，即妈祖林默娘逝世当年。另，位於莆田县西天尾乡龙山村林搀打诅祠(林姓祠堂)，人称「九牧祖祠」。内留有妈祖，先辈绸吴提之石刻，反妈祖石雕神像。曾在迎奉湄州妈祖莅台时，随同而来。 

　　湄洲岛对岸贤良港「天后祖祠」建於未朝。其中妈祖软身神像，系南宋精品。亦为台湾妈祖回銮时，谒祖必经之庙。 

　　清康熙22年(1683)。福建总督姚启圣建造钟楼、鼓楼、山门，将朝天阁改为正殿 (俗称太子殿)。之後，施琅奏请增建梳妆楼，朝天阁、佛殿和僧房。 

　　今朝天阁，为鹿港天后宫在民国78年(198劲7月所建。阁内悬有台湾「黑脸妈祖」影像。每数年辄组团「湄洲谒祖」，至今还保存鹿港天后宫乾隆丁未(1787)湄洲进香正炉。 

　　而湄洲岛上。由北港朝天宫捐塑「妈祖石像」、则远观，甚为典雅。瞻仰於前，静肃默祷，期能远庇。实为「千里会香」之明证! 

　　台湾各庙回湄洲谒祖之多，难以估计。已然成为两岸交流之中流。

　　另外，在<安平天后宫>简介中记载传说：「护军妈祖，除了显灵护佑郑成功得以攻克台湾以外，尚有多项神迹，广为地方人上所流传。郑成功恭请三尊妈耐题市攻取台纯之後、木应将妈祖送回洲洲耐庙。但郑成功到台湾，少之经过 年二个月，武因病去世了;送回妈祖一事。就被耽搁了下来。此後明郑与清廷一直对峙土康熊22年(1683)，郑克垧降尚，东湾肃人清廷版图;湄洲祖庙趁机派人前来索取妈祖神像，但为安平地方人士所拒， 双方为此农牛争议 。当时湄洲祖庙派人送来二尊相同的妈祖神像，要换回郑成功请来的三尊正身妈祖，安平人为保有正身妈祖，故意出题刁难来人 要以磁(瓷)碗作菱，并卜百茭以定神意。来人市在(察)，  来人不查当即答应，而发生了一段颇趣味性的神奇故事。